Οι αποθήκες μπορούν να ταξινομηθούν με διαφορετικούς τρόπους σύμφωνα με διαφορετικά πρότυπα. Οι κοινές ταξινομήσεις αποθήκης περιλαμβάνουν:
Εξειδικευμένες Αποθήκες
Οι εξειδικευμένες αποθήκες είναι εξοπλισμένες με εγκαταστάσεις ψύξης και μόνωσης. Είναι κατάλληλα για την αποθήκευση αγαθών με ειδικές ιδιότητες ή που απαιτούν συγκεκριμένο τεχνικό εξοπλισμό. Προϊόντα όπως η ζάχαρη, τα φρούτα, τα δημητριακά, τα φαρμακευτικά βότανα και το κρέας πουλερικών είναι επιρρεπή στο λιώσιμο, τη μούχλα και τη σήψη και αποθηκεύονται σε μεγάλες ποσότητες, απαιτώντας αποθήκευση στο ψυγείο ή σε σταθερή θερμοκρασία.
Αποθήκες γενικής χρήσης
Οι αποθήκες γενικής-χρήσης, γνωστές και ως συνηθισμένες αποθήκες ή ολοκληρωμένες αποθήκες, αναφέρονται γενικά σε αποθήκες με αποθήκευση σε θερμοκρασία περιβάλλοντος, φυσικό αερισμό και χωρίς ειδικές λειτουργίες. Οι αποθήκες γενικής χρήσης-διαχειρίζονται τα εμπορεύματα ανά ζώνη και κατηγορία σύμφωνα με την αρχή των συνεπών ιδιοτήτων του προϊόντος και των μέτρων συντήρησης. Αυτές οι αποθήκες δεν απαιτούν ειδικό τεχνικό εξοπλισμό και αποτελούν μεγάλο ποσοστό των εμπορικών αποθηκών στην Κίνα.
Αποθήκες Επικίνδυνων Υλικών
Οι αποθήκες επικίνδυνων υλικών είναι εξειδικευμένες αποθήκες εξοπλισμένες με ειδικό εξοπλισμό και αντίστοιχα-μέτρα πυρόσβεσης για την παροχή ενός συγκεκριμένου επιπέδου προστασίας για επικίνδυνα υλικά. Επειδή τα επικίνδυνα υλικά είναι εύφλεκτα, εκρηκτικά, τοξικά, διαβρωτικά ή ραδιενεργά, δεν πρέπει να αποθηκεύονται μαζί με γενικά προϊόντα. Το πρωταρχικό καθήκον μιας αποθήκης επικίνδυνων υλικών είναι να διασφαλίζει την ασφαλή αποθήκευση διαφόρων επικίνδυνων υλικών.
